呼和浩特市中蒙医院始建于 1958 年，中蒙医研究所与中蒙医院合署办公，座落于自治区首府呼和浩特市中心，是自治区规模少有、技术力量最雄厚、医疗和科研水平较高的中蒙医医院和中蒙医研究所。 1991 年被国家中医药管理局列为“国家蒙医专科培训基地”和“国家蒙药制剂中心”。院所占地面积 4. 4 万平方米 ，建筑面积 7. 3 万平方米 ，设有 450 张病床， 36 个临床科室，现有职工 725 人，其中卫生技术人员 606 名、高级职称技术人员 92 人、中级职称技术人员 241 人，拥有螺旋 CT 、全自动生化分析仪、彩色超声多普勒等先进的大型医疗设备。
呼和浩特市中蒙医院不断加强内涵建设，坚持“质量是生命、特色为根本、管理出效益、改革促发展、科技兴院所”的治院方针，先后被国家中医药管理局评为“三级甲等中蒙医院”，被卫生部、国家中医药管理局、总后卫生部授予“全国百佳医院”，被人事部、卫生部、国家中医药管理局评为“全国卫生系统先进集体”，被蒙古国授予“单一信得过医院”，被内蒙古物价局评为“全区执行物价政策法规极佳医院”。院所经过 40 多年的建设与发展，成为一所管理科学、特色浓郁、专家荟萃、设备先进、功能齐全，集医疗、科研、教学、康复、保健、制剂于一体的现代化中蒙医研究所和中蒙医医院。
蒙医萨病（脑血管病）、五疗科、中医心内科、急症内科等学科被确定为内蒙古自治区的重点专科，形成了独具特色的诊断治疗体系。